桂林高新區積極鼓勵企業進行科技創新，不斷提高企業自主創新能力，積極組織企業申報各類科技項目，幫助企業獲得資金支持，扶持企業做大做強，鼓勵企業大力開發擁有自主知識產權的產品，以高新技術提升傳統產業的發展。

      2009年上半年，桂林高新區共獲得國家創新基金項目4項，獲無償資助資金支持250萬元，其中桂林星鉆超硬材料有限公司“超細晶粒高性能金剛石復合齒”項目30萬元、桂林新力科技有限公司“面向中小企業的工模檢具開發制造公共技術服務平臺”80萬元、桂林瀚特信息產業有限公司“基于超高頻RFID技術的城市公交優先交通控制系統”70萬元、桂林寶利新技術開發有限公司“多重分選管磨機”70萬元，這些扶持資金有力地扶持了企業的發展。據統計，桂林高新區自2000年以來共獲得國家創新基金項目26項，資金1600萬元。

      桂林高新區管委會是科技部創新基金管理中心認定的創新基金項目組織單位，桂林科技創業中心是科技部創新基金管理中心認定的創新基金項目服務機構。根據科技部的要求，桂林高新區自2005年起設立了自己的科技型中小企業技術創新基金（以下簡稱創新基金），旨在推動科技型中小企業的技術創新，促進科技成果轉化，加快高新技術產業化進程，推動建立符合市場經濟規律的技術創新投融資機制，營造有利于技術創新和發展的良好環境，培育新的經濟增長點。創新基金由桂林高新區管委會列入年度財政預算，專項列支，每年額度為1000萬元人民幣，主要以貸款貼息、無償資助的方式支持科技型中小企業的技術創新活動。貸款貼息：主要用于支持產品具有一定水平、規模、效益、銀行已經貸款或有貸款意向的項目。無償資助：主要用于科技型中小企業新技術、新產品研究開發及中試階段的必要補助。申請創新基金支持的項目需符合條件：符合國家產業、技術政策，技術創新性較強，技術含量較高，有明確的市場需求、較大的市場容量和較強的市場競爭力，可以產生較好的經濟和社會效益，并有望形成新興產業。鼓勵并優先支持市場前景好、技術成熟、有地方優勢、地方特色的項目；優先支持產、學、研聯合創新項目；優先支持具有自主知識產權、高新技術、高附加值、產業關聯度大、節能降耗有利于環境保護以及出口創匯的各類項目。